La Lingüística Indígena es de las materias en las que más se han centrado los estudios indigenistas, tanto de autores académicos e indígenas.

Durante muchos siglos el estudio de las lenguas indígenas estuvo representada por los investigadores extranjeros, posteriormente, por investigadores nacionales, pero hoy día, también hay autores de los pueblos formalizando algunos conocimientos desde su lengua.

Los temas más recurrentes en la lingüística indígena se centran en los sistemas de alfabetización, en los problemas de traducción, en la pérdida de la lengua y las lenguas en riesgo.